中藥指紋圖譜按應(yīng)用對象分類，根據(jù)中藥指紋圖譜可用于中藥制劑研究、生過程的各個階段，可分為中藥材(原料藥材)指紋圖譜、中藥原料藥(包括飲片配伍顆粒)指紋圖譜和中藥制劑指紋圖譜。如分得更細，還可包括用于工藝過程中間產(chǎn)物的指紋圖譜。兩種中藥原料藥指紋圖譜應(yīng)區(qū)別對待。對中藥竹指紋圖譜的要求基本和中藥材指紋圖譜相同。對中藥配伍顆粒(包括標準提.指紋圖譜應(yīng)要求高一點。

隨著現(xiàn)代科技技術(shù)的發(fā)展而發(fā)展，中藥指紋圖譜研究所采用的方法大致分為:

色譜法:薄層色譜法 (TLC) 、液相色譜法 (LC) 、氣相色譜法 (GC) 、高效毛細管電泳法 (CE) ;

光譜法:紫外光譜法(UV) 、紅外光譜法 (IR) 、近紅外光譜法 (NIR) : 核磁共振法 (MR) 等。

色譜聯(lián)用技術(shù):將色譜良好的分離能力與光譜或波譜特有的結(jié)構(gòu)鑒別能力相結(jié)合并借助近年來發(fā)展起來的化學計量學技術(shù)和己有的光譜波譜標準庫，是完全可能對大部分中藥的化學成分進行定性和相對定量分析的。目前色譜光譜聯(lián)用技術(shù)如:GC-MS 、HPLC-MS已經(jīng)在中藥指紋指紋圖譜研究領(lǐng)域內(nèi)獲得了一定的成功。